Struktura kromatina igra važnu ulogu u regulaciji ekspresije eukariotskih gena.
Regulacija ekspresije gena odvija se u jezgri (remodeliranje strukture kromatina; metilacija DNA; amplifikacija gena; transpozoni i retrotranspozoni; transkripcija; RNA procesiranje) i u citoplazmi (translacijska i posttranslacijska kontrola).
U eukariota regulacija ekspresije gena odvija se na više razina a ovisi o organizaciji genoma odnosno kromatina
Epigenetske modifikacije kromatina utječu na ekspresiju gena i reverzibilne su.
Rak nastaje zbog poremećaja u kontroli stanične diobe: aktivacija onkogena i gubitak aktivnosti tumor-supresorskih gena.