Strukturne promjene ili kromosomske aberacije uključuju delecije, duplikacije, inverzije i translokacije.
Delecija je posljedica loma i gubitka kromosomskog segmenta.
Duplikacija kromosomskog segmenta nastaje nepravilnom kromatidnom izmjenom ili pomakom kromosomskog segmenta na novo mjesto, te parenjem kromosoma i kromatidnom izmjenom.
Inverzije uključuju dva loma, rotaciju segmenta za 180°, te ponovno spajanje što uzrokuje problem kod sparivanja homolognih kromosoma.
Translokacija nastaje nakon loma i pomaka kromosomskog segmenta na drugi nehomologni kromosom (jednosmjerna) ili kada dva nehomologna kromosoma nakon loma izmjenjuju svoje dijelove (recipročna translokacija).